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新辅助化疗(NAC)是许多缺乏雌激素和孕激素受体以及HER2受体的三阴性乳腺癌(TNBC患者)的标准治疗方法。尽管NAC对一些TNBC患者有效，但大约一半会产生化疗耐药性。研究人员正在努力开发和改进克服化疗耐药性的方法。现在，贝勒医学院、麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的研究人员以及圣路易斯华盛顿大学的临床医生已经确定了TNBC中与化疗耐药性相关的生物标志物。

他们的发现发表在CancerDiscovery的一篇题为“三阴性乳腺癌化疗耐药和反应的蛋白质组学标记”的论文中。

研究人员写道：“微观蛋白质组学被用于探索对TNBC新辅助卡铂和多西紫杉醇联合化疗的差异反应的分子基础。”

“TNBC是最难治疗的乳腺癌形式，标准治疗需要多种化疗药物，不幸的是，这些化疗药物往往无法治愈患者，”第一作者兼共同通讯作者、莱斯特大学医学助理教授MeenakshiAnurag博士说。贝勒的苏史密斯乳房中心。

研究团队使用了他们之前开发的一种称为“微尺度蛋白质组学”的创新分析方法。他们将来自标准DNA和RNA测序方法的数据与基于质谱的蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学分析相结合，以得出更完整的治疗反应性肿瘤与治疗耐药性肿瘤的分子图谱。

“预处理活检的蛋白质组学分析独特地揭示了与治疗耐药性相关的代谢途径，包括脂肪酸代谢，”Anurag说。当研究小组同时考虑蛋白质组学和基因表达数据时，他们观察到对化疗的敏感性表现为更高的DNA修复特征、干扰素伽马信号和免疫检查点成分。这些数据表明化疗反应的多组学预测指标触手可及。

然后，该团队进行了分析，对治疗反应、染色体缺失或增加以及mRNA和蛋白质表达的一致减少或增加进行了三角测量。DNA连接酶基因LIG1是mRNA和蛋白质水平上最一致抑制的基因之一。在模型系统和其他TNBC数据集中，LIG1的表达缺失和/或缺失与选择性卡铂耐药和不良临床结果相关。

“LIG1缺失也与其他癌症类型的不良预后相关，表明这种缺失具有更广泛的临床意义，”Anurag说。研究人员目前正在进行临床级检测，以确认LIG1缺失可以安全地用于指导TNBC中的卡铂化疗。

MatthewEllis博士是Baylor的McNair学者，在进行这项研究时是Lester和SueSmith乳房中心的主任，SteveCarr博士是蛋白质组学平台的高级主管和Broad的研究所科学家，他们共同策划了分析说，“这项开创性的研究清楚地揭示了将微观蛋白质组学分析与仔细的临床研究相结合的力量，可以对癌症的性质产生新的见解。”